Morda ste že slišali za Folding @ home, priljubljeno aplikacijo, ki jo je mogoče zagnati v računalniku in pomagati raziskovalcem pri reševanju nekaterih zdravstvenih težav, vključno z novim koronavirusom.
V zadnjem mesecu se je mreža prostovoljcev, ki so jo namestili, tako razširila, da platforma presega najmočnejše superračunalnike na svetu.
Po besedah direktorja in biokemika Folding @ home Grega Bowmana se je v zadnjih tednih pridružilo skoraj 700.000 novih operaterjev Folding @ home. To je velik porast glede na 30.000 ljudi, ki Folding @ home ves čas uporabljajo.
In prav tako zelo vpliva na računalniško moč – omrežje Folding @ home je v začetku tega tedna doseglo osupljivih 2,4 eksaflopov računalniške moči, zaradi česar je hitrejše kot 500 najboljših svetovnih superračunalnikov skupaj.
Glavna naloga Folding @ home je modeliranje obnašanja beljakovin v telesu, ki temelji na številnih osnovnih bioloških funkcijah.
Te funkcije vključujejo virusno okužbo: ekipa Folding @ home preučuje zlasti, kako se tako imenovani “konica” virusa SARS-CoV-2 (ki je dejansko sestavljen iz treh beljakovin) pritrdi na človeške celice in okuži človeško telo.
To je ključni način za vstop novega koronavirusa v človeško tkivo, zato bi lahko bilo njegovo blokiranje ključnega pomena za prihodnje zdravljenje in cepljenje. Če lahko razumemo, kako delujejo beljakovine spike – kaj počnejo računalniške simulacije Folding @ home – potem lahko bolje razvijemo zdravila, da jih ustavimo.
Konica beljakovine SARS-CoV-2 v akciji. (Zložljivo @ doma / YouTube)
“Če bi poskušali takšen postopek simulirati na domačem računalniku, bi imeli to srečo, da bi videli celo del procesa v naslednjih 100 letih,” piše Bowman na blogu Folding @ home. “Na srečo imamo okrepitev!”
Čarobnost Folding @ home je v tem, da zapletene računalniške simulacije vedenja beljakovin razdeli na manjša opravila, ki jih lahko nato razdelijo na tisoče računalnikov po vsem svetu – pri čemer vsak vzame kos.
Folding @ home izvaja tudi številne druge projekte, povezane s koronavirusom: obdeluje podatke za oceno učinkovitosti potencialnih zdravil, ki se zdaj preizkušajo v laboratorijih, in za analizo, kako koronavirus nadzoruje celični mehanizem po okužbi.
